ภาควิชาวิศวกรรมอุตสาหการ คณะวิศวกรรมศาสตร์ กำแพงแสน มุ่งมั่นที่จะสร้างองค์ความรู้ใหม่ๆ เพื่อแก้ไขปัญหาที่เกิดขึ้นทั้งในส่วนของภาคการเกษตร และภาคอุตสาหกรรมมาอย่างต่อเนื่อง ตลอดระยะเวลาที่ผ่านมาทางภาควิชาวิศวกรรมอุตสาหการได้จัดตั้งหน่วยวิจัย (Research Units) ขึ้นมาภายใต้ความร่วมมือระหว่างภาควิชาวิศวกรรมอุตสาหการ ศูนย์ความเป็นเลิศทางวิชาการด้านโลจิสติกส์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ และหน่วยงานภาคนอกมหาวิทยาลัย เพื่อร่วมกันแก้ไขปัญหาต่างๆ ที่เกิดขึ้นในภาคการเกษตร และภาคอุตสาหกรรม และที่สำคัญเพื่อให้นิสิตของภาควิชาฯ ได้เรียนรู้ ฝึกปฏิบัติ และแก้ไขปัญหาที่เกิดขึ้นจากสภาวะการณ์จริง มีผลงานเป็นที่ประจักษ์และยอมรับมากมาย

               หน่วยวิจัย (Research Units) ภาควิชาวิศวกรรมอุตสาหการ คณะวิศวกรรมศาสตร์ กำแพงแสน ประกอบด้วย 4 หน่วยวิจัย ดังนี้